Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARXQ96QS3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms