Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB3IPQ96QF0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB3IPQ96QF0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms