Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSMCE2Q96MF7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms