Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms