Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC136Q96JN2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms