Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COG3Q96JB2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COG3Q96JB2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms