Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCMH1Q96GD3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms