Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC97Q96F63 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms