Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNFT2Q96EX2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms