Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF501Q96CX3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF501Q96CX3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF501Q96CX3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms