Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYTL4Q96C24 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms