Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM3DQ96BQ1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM3DQ96BQ1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms