Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UTP4Q969X6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms