Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKD1Q969G9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms