Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMARCE1Q969G3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms