Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRUQ92729 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms