Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms