Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms