Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NLGN4YQ8NFZ3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLGN4YQ8NFZ3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms