Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF548Q8NEK5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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