Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZIC4Q8N9L1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms