Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC17Q8N6Y2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms