Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SVOPQ8N4V2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms