Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ATG4DQ86TL0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ATG4DQ86TL0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4DQ86TL0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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