Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLNKQ7Z7G1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms