Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms