Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WDR88Q6ZMY6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms