Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms