Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG16L1Q676U5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms