Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDSS1Q5T2R2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms