Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP188Q5SRE5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP188Q5SRE5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms