Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRMS1LQ5PSV4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRMS1LQ5PSV4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms