Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGD3Q5JSP0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGD3Q5JSP0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms