Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ESCO2Q56NI9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms