Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms