Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RFTN2Q52LD8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms