Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDCCQ504Y2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKDCCQ504Y2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms