Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00303Q3SY05 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms