Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TTLL9Q3SXZ7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTLL9Q3SXZ7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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