Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP21-3Q3LHN1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms