Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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