Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC142Q17RM4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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