Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IMPG1Q17R60 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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