Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms