Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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NDUFA9Q16795 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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NDUFA9Q16795 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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NDUFA9Q16795 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA9Q16795 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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