Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms