Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDC37Q16543 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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