Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK5Q16478 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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