Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F4Q16254 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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