Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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NEDD8Q15843 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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NEDD8Q15843 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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NEDD8Q15843 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NEDD8Q15843 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8Q15843 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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